升级后的新版生物医学应用软件ECR50和专用于DNBSEQ-T7的甲基化高通量测序试剂套装(T7MethylationFCLPE150)现已同步上线。即日起,用户可享受软件升级服务,并可购买甲基化测序试剂套装,详尽订购指南请见文末。
DNBSEQ-T7甲基化高通量测序试剂套装
与此同时,新一代建库产品MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(以下简称“WGMSV30”)已成功与DNBSEQ-T7平台适配。得益于升级的算法,结合DNBSEQ-T7RS甲基化高通量测序试剂套装,用户在测序时可显著降低平衡文库的混合比例,甚至无需添加平衡文库,实现“100%纯甲基化文库”的高质量测序。
用户案例
以下为不同研究机构使用DNBSEQ-T7进行甲基化测序的一些案例:
- 用户坐标:天津,样本类型:人、猪、植物,建库试剂:第三方,测序方案:100%甲基化文库
- 用户坐标:武汉,样本类型:多样本混测(人、昆虫、水果、植物、鱼类等),建库试剂:第三方
- 用户坐标:上海,样本类型:人肿瘤样本,建库试剂:第三方
- 用户坐标:哈尔滨
- 用户坐标:深圳,样本类型:NA12878人标准品,建库试剂:MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30
数据性能分析
通过MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30构建的NA12878标准品DNA甲基化文库,经过12个样本的DNB等量pooling后,在DNBSEQ-T7平台进行测序。结果表明,每个芯片均可获得高reads产出,测序质量出色,达到100%纯甲基化文库的高质量测序标准。在分析中,12个样本的raw base≥100Gb,Q30%的比例超过92%。
此外,使用不同批次样本、不同建库试剂批次及不同建库起始量下的9个样本文库,结果显示DNBSEQ-T7测序数据的清洁率≥99%,Uniquely Mapped Rate超过90%,Duplication Rate不超过5%,平均测序深度均≥30x,全基因组10×coverage可达≥96%。另外,质控文库Lambda DNA的非甲基化C转U的转化率也大于99%。
甲基化检测一致性
分析显示,随机挑选的3个NA12878甲基化文库在4×测序深度下检测到的独有和共有CpG位点的覆盖一致性为94%,不同文库间的甲基化率一致性高达94%。与935K芯片的甲基化检测比对,MGI WGMSV30与DNBSEQ-T7的甲基化建库测序方法在各个有效测序深度下均表现出色,检测到的位点占比更多,甲基化水平相关性更高。
未来展望
2024年,华大智造的高通量旗舰机DNBSEQ-T7受到多个生态伙伴的持续引入,彰显其强大的生物医疗应用能力。作为生命科技核心工具的提供方,华大智造不仅自主研发并生产从Gb级至Tb级的临床级基因测序仪,还具备多种基因测序技术与产品,致力于推动生命科技的创新与发展。
展望未来,华大智造将围绕生命的“读、写、存”,以“SEQALL”(全读长)为目标,携手全球生态伙伴,聚焦下游应用需求,持续推出更灵活、更具多样性和完整性的生命解码工具,积极推动生命科技与人生就是博-尊龙凯时,真正飞入千家万户。